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云顶娱乐旧版本重磅推出单细胞转录组测序服务!

来源:小博发布时间:2018-06-06

Chromium™系统-单细胞转录组测序服务

单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing)是在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序的一项新技术,除了对单个细胞进行信息挖掘外,也可利用自动化平台来完成细胞图谱的绘制,实现大量细胞的分群。在众多平台中,10x Genomics ChromiumTM平台可谓是自动化完成大规模单细胞研究中的佼佼者,其技术核心是含有75万种Barcode的油滴包裹的凝胶珠(GEM)。2018年至今,利用该平台研究单细胞转录组就已发表30余篇文章,囊括了Cell、Nature、Science等国际刊物。云顶娱乐旧版本现推出基于ChromiumTM_10X系统平台的单细胞转录组测序服务!

项目流程

1. 细胞浓度500-2000个/μl;体积>200μl;细胞总数>10^5。
2. 细胞不成团,少碎片,存活率>90%,无逆转录抑制剂。
3. 在10分钟内自动完成多至80,000个细胞的捕获;GEM形成后,细胞裂解,凝胶珠释放Barcode序列;mRNA逆转录产生带有Barcode和UMI信息的cDNA;以cDNA为模板进行PCR扩增,建库、测序。
4. 数据分析,此时Barcode标记细胞,UMI标记转录本并用于后续定量。
 
项目优势

样品收集Easy!Fast!:细胞悬液样本即制即取,无需冻存,专人现场完成细胞计数;
检测通量High:一次性可完成500–10000个单细胞的表达谱检测,110G/Lane;
检测平台New:10 X Genomics或NovaSeq;
捕获效率High:10min内处理100-80,000个细胞,细胞捕获率高达65%;
平台兼容High:与Illumina测序平台高度兼容(HiSeq4000/2500/NextSeq/MiSeq)
 
项目分析



部分结果展示:

左:有效细胞评估图及测序饱和曲线图
中:细胞分群图(不同颜色代表不同亚群,右侧图例为亚群名称与对应的亚群颜色)
右:细胞分群相关性图(Color Key由pearson相关系数确定,颜色越深,亚群相关性越大)

左:细胞亚群top20基因聚类热图(每列为1个基因,每行为1个Cluster)
右:细胞亚群top20基因表达热图(首图不同颜色代表不同cluster的细胞;其它图为某一亚群的top20基因在所有细胞中的表达热图)
 
样品要求:细胞浓度500-2000个/μl;体积>200μl;细胞总数>10^5。

取样事宜:提前沟通取样时间,客户当天制备细胞悬液后,无需冻存,当天公司有专人带仪器过去取样,现场进行细胞计数,若样本合格即时取回。